Ο Γιάννης Μαρακάκης παντρεύτηκε με τη Νίκη Θωμοπούλου το 2016, σε στενό οικογενειακό κύκλο, στο εκκλησάκι του Αρχαγγέλου Μιχαήλ στο «Κτήμα 48» στην Ανάβυσσο, μετά από 1,5 χρόνο σχέσης περίπου και ζει σ’ ένα πανέμορφο σπίτι στα νότια προάστια.
Η ευτυχία του ζευγαριού ολοκληρώθηκε με τον ερχομό της κόρης τους, πριν από δύο χρόνια και όπως είναι λογικό, τα κοριτσίστικα παιχνίδια κυριαρχούν στο σπίτι.
Όπως φαίνεται στις φωτογραφίες που ανεβάζει κατά καιρούς η Νίκη Θωμοπούλου στον προσωπικό της λογαριασμό στο instagram, στο σπίτι κυριαρχούν οι μαύρες και οι γκρι αποχρώσεις.